自然保护与生物多样性研究室是环境保护部在生物多样性领域最主要的技术依托机构，是国家履行《生物多样性公约》的技术牵头单位，设有3个一级学科：生物多样性、遗传资源学科，自然保护区学科，生物安全学科。20世纪90年代初就较早开展了生物多样性研究，在生物多样性、自然保护区、生物安全、生物物种资源、外来入侵物种、可持续旅游、生物多样性影响评价、生物多样性数据管理和信息网络化等方面开展了大量原始性、前瞻性的基础研究和应用研究。先后主持并完成“中国自然保护区发展规划纲要”、“全国自然保护区发展规划（2006-2020年）”、“中国生物多样性保护中长期战略方案”、“全国生物物种资源保护与利用规划”、“履行《生物多样性公约》的关键基础技术研究”、“转基因植物环境安全性评价和环境影响监测”、“自然保护区与生物多样性信息共享”等国家973、科技攻关、高技术应用和国家环保总局重大项目，以及UNEP/GEF资助的“中国生物多样性国情研究报告”、“中国履行《生物多样性公约》国家报告”、“中国生物多样性数据管理和信息网络化能力建设”、“中国生物多样性信息交换机制能力建设”、“中国国家生物安全框架”、“中国国家生物安全框架实施项目”等40余项，绝大多数研究成果被国家有关部门所采用，在国家生物多样性保护与持续利用的科学决策和有效管理中发挥着重要的作用。

　　现有科研人员16名，其中高级研究人员6名，中级研究人员7人；博士5人，硕士8人。客座研究员2人，在读硕士研究生6人。3人荣获国务院政府特贴，1人入选“新世纪百千万人才工程”国家级人选，4人次入选江苏省“333新世纪科学技术带头人培养工程”第二、三层次培养对象。获国家科技进步三等奖2项，国家环保总局科技进步一等奖1项、二等奖3项、三等奖3项。主篇（参编）专著20余部，主编地图1幅。在国内核心期刊和SCI刊物发表论文近200篇。建有生物多样性信息网1个，主编国外生物安全刊物1种。

　　每年有近10人次赴多国开展学术交流。与多个国家的科研机构和国际组织建立了良好的合作关系。