刘国才
所长、党委书记 教授 博士生导师
男，汉族，1965年4月出生，中共党员，研究生学历，博士学位，教授。
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李维新
副所长 研究员 博士生导师
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孔令辉
副所长 研究员
男，汉族，1969年8月出生，中共党员，研究生学历，硕士学位，研究员。
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朱风松
纪委书记 正高级工程师
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邹长新
副所长 研究员 博士生导师
男，汉族，1977年8月出生，中共党员，研究生学历，博士学位，研究员。
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1978年
江苏省革委会决定成立江苏省环境科学研究所。
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1983年
江苏省环境科学研究所更名为：城乡建设部南京环境科学研究所。
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1988年
原城乡建设环境保护部撤销，更名为：国家环境保护局南京环境科学研究所。
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1998年
原国家环境保护局升级为国务院直属总局，更名为：国家环境保护总局南京环境科学研究所。
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2008年
国务院机构改革，成立环境保护部，更名为：环境保护部南京环境科学研究所。
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2018年
国务院机构改革，环境保护部组建为生态环境部，更名为：生态环境部南京环境科学研究所。
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