新污染物中心拥有高水平的科研条件支撑体系，与化学品生态效应与污染防治研究中心共建有生态环境部农药与新污染物环境风险管控重点实验室，实验用房占地3500m2，科研能力与基础条件雄厚，为开展新污染物领域高水平研究提供了坚实的硬件保障。实验室建有抗生素抗性基因高效降解技术研发平台、全氟化合物环境风险诊断与治理平台、抗生素耐药性风险评估平台、水处理功能材料研发平台、新污染物毒性试验用溞可控生态智能养殖系统、新污染物毒性试验用鱼可控生态智能养殖系统等专业化实验系统，可支撑复杂环境介质中的痕量新污染物的快速筛查定性与准确定量分析、新污染物多介质迁移转化规律研究与毒性效应解析、新污染物高效分离与催化降解技术开发以及协同耦合治理关键技术研发等研究工作需要。