生态环境部有机食品发展中心自成立以来，在有机农业生产技术、有机产品认证技术、有机农业环境效益评估方面开展了大量的研究，发表论文100多篇，出版专著20多部，为有机农业与有机产品学科的发展奠定了良好的基础。近年来主持和完成的主要课题如下：

产业政策

国家十五科技攻关项目"农产品生产环境安全保障与技术研究"；

国家质检总局科技计划项目"有机产品进出口控制体系研究" 子课题"美国和加拿大有机产品进出口控制体系研究"。

标准与生产关键技术

湖北省环境科技专项"清洁种植和清洁养殖生产技术规程"；

国家科技支撑项目子课题"城郊保留农田生态经济服务功能转型技术与应用研究"；

科技部重点攻关项目《农产品生产环境安全保障措施与技术研究》；

香港绿色和平项目《中国有机农业生产效益比较研究》；

德国Amber基金会项目《中国西北干旱地区有机农业发展》；

公益行业（农业）科研专项子课题“南方湿润平原区农业面源污染监测与氮磷化肥投入阈值研究”；

全国污染源调查课题“太湖流域农业源产排污系数测算”；

国家科技重大专项课题“东江源头区水污染系统控制技术集成研究与工程示范研究”；

国家科技支撑项目“有机产品产地环境适宜性及区域优势评价关键技术研究”；

环保公益性行业科研专项"坝上地区自然保护区有机食品开发与生物多样性保护研究"；

2013年公益性行业科研专项“有机农业生态环境效益定量化评估与管理模式研究”；

国家科技重大专项子课题“典型集水区氮磷污染负荷与特征痕量有机污染物风险预测与控制应用”；

国家科技重大专项子课题“水产养殖污染物减排核算方法研究与减排政策综合示范”；

云南省环保基金项目“有机农业土壤-水质耦合的土壤修复关键技术与应用示范”；

所公益基金课题"地衣芽孢杆菌W10控制有机蔬菜灰霉病技术与效应"、"控释氮肥对农业面源污染控制效应研究"、"农村环境污染综合整治主题研究"、"太湖流域发展有机农业控制面源污染研究"；

《有机产品标准》、《有机产品认证实施规则》及《有机产品管理办法》修订项目；

红塔集团有机烟叶开发及研究；

贵州省烟草总公司科技项目"贵州省烤烟生产GAP管理研究与推广应用"；

泸州市烟草专卖局科技项目"泸州烤烟良好农业规范(GAP)管理模式研究及推广应用" 。

产业发展规划

开创了中国区域有机产品发展规划研究领域，并编制了百余项省、市、县级有机产品发展规划。

宣传培训与推广

每年举办全国有机产品开发和信息交流讲习班以及区域性培训活动，受益者累计达100多万人次。

1996年创办了国内首家有机农业与有机产品方面的通讯专刊——《有机食品时代》。

1999年起举办了多届有机产品博览会及有机产品发展战略研讨会—— 开创了中国有机产品展览会的先河，搭建了有机产品贸易的长期交流平台。

与多家国内外知名媒体合作开展了有机农业与有机产品方面的宣传。

国际交流

多次代表中国有机界参加由联合国粮农组织、联合国环境规划署、联合国贸易与发展大会、国际有机农业运动联盟等国际机构组织的国际研讨会和论坛等重要活动。

先后有2人被选为IFOAM标准委员会和发展委员会委员。

与世界自然基金会、国际农业发展基金以及美国、荷兰、加拿大等国的机构合作，为科研和发展项目提供专家咨询服务。

与英国土壤协会（Soil Association）、瑞典Grolink、瑞士FiBL、美国OCIA、日本JONA、澳大利亚NASAA、意大利BAC、ICEA等世界著名的有机农业发展机构保持长期良好的合作。